Yemek borusu, mide ve bağırsakların gelişmiş optik cihazlarla doğrudan görüntülenmesi, gerektiğinde biyopsi alınması yoluyla sindirim sistemi hastalıklarının teşhisine imkan veren işleme Endoskopi denir. Eğer yemek borusu, mide ve onikiparmak bağırsağını görüntülemek için endoskopi yapıyorsak buna özofagogastroduodenoskopi denir. Eğer bu işlem kalınbağırsak için yapılıyorsa bunun adı da kolonoskopidir.